Nació el 19 marzo de 1828 en Guanaceví. Sus padres fueron Juan Bautista Patoni y Mercedes Sánchez. Fungió como comandante militar estacionado en Santiago Papasquiaro para la defensa de Durango contra los comanches en 1846, según registro oficial. Fue comandante de los rifleros de Chihuahua con el grado de coronel, participó el 8 de julio de 1858 en la toma de Durango por los liberales; ejerció como gobernador interino el 8 de noviembre de 1859. El 9 de febrero de 1860 luchó contra el conservador Domingo Cajén, el cual derrotó a Patoni en las haciendas de La Flor y Santa Bárbara, Nazas. Patoni se recuperó y venció a los conservadores en San Ignacio. Regresó como gobernador el 10 de agosto de 1861. Defendió el fuerte de ingenieros en la batalla de Puebla, donde recibió el grado de general de brigada; fue hecho prisionero y se fugó para incorporarse a las fuerzas del presidente Juárez en su recorrido por San Luis Potosí hacia Paso del Norte; volvió a ocupar la gubernatura de Durango del 4 de julio de 1863 al 6 de marzo de 1864; se enfrentó a los franceses en las batallas de Menores y Mahoma. Sostuvo al general González Ortega para la presidencia contra Juárez; tuvo que huir hacia los Estados Unidos. A su regreso murió fusilado a espaldas del mesón del Refugio el 18 de agosto de 1868 a los 43 años. Una calle del centro histórico de Durango lleva su nombre, así como una antigua hacienda de Menores de Arriba. Casado con Dolores Escárzaga con quien tuvo a sus hijos Victoria y José María. Celebró segundas nupcias con Josefa Flores.